При условии если регистрация была оформлена на внутренний паспорт, не обнулится ли регистрация если, выехать из кыргызстана в рф по внутреннему, а обратно по заграну?

Скорее всего обнулится, тк по документу указанному в регистрации будет выезд, но не будет въезда. Точно не помню, но возможно можно сходить в цон и данные в регистрации поменять на новые.

Если у вас все паспорта ассоциированы у пограничников, тогда ничего быть не должно. Я выезжал и заезжал по другому паспорту и жил потом несколько месяцев до продления, продлил без проблем, но продлить можно только на тот же паспорт, по которому была регистрация.