Подскажите пожалуйста, между бакалавриатом и магистратурой почти у всех есть промежуток, летние каникулы.

Нужно ли в personal history, а также в education указывать это как разные промежутки? Ну если вы в это время не числились в вузе, то да, указывайте эти промежутки. В education вы все равно все учебу будете разбивать на каждую из программ, а для загрузки документов поле будет одно, куда все вместе и положите.