Если у меня открыто ИП по малому бизнесу, но я не являюсь налоговой резидентной Грузии, должна ли я платить НДС работая с иностранными компаниями?

Обязанность оплаты НДС зависит не от резидентсва, а от места оказания услуг. По нему много нюансов, изучайте статью, НК Грузии, анализируйте свой кейс.