У кого есть опыт репатриации в Израиль и жизни там, подскажите пожалуйста, что делать.

Никак, заменить надо было личинку замка.

Прочитайте сначала условия договора. Если есть фраза о том, что вы должны уведомить хозяина о протечках и пр. неполадках в такой-то срок, то ситуация не в вашу пользу. Собственно если вы ничего не скрывали от хозяина и не знали о протечке, которая образовалась во время вашего отсутствия, то вы можете пытаться это доказать. У вас и про проверки состояния жилья тоже в договоре может быть фраза. В любом случае вам нужен местный юрист если договориться с хозяином не получится.