Подскажите пожалуйста, в миграционной карте для перелёта на Шри-Ланку заполнять аэропорт отправления Россия или аэропорт, где у нас стыковка? В нашем случае Абу-Даби.

Не имеет никакого значения. Фактически вы отправились из России? Ее и пишите.

Я пишу всегда номер рейса, на котором прилетел в Кодомбо, то есть из Абу-Даби. И аэропорт , соотв, Абу.

Без разницы, пишите, что хотите, её никто не читает...