Подскажите есть ли обменники долларов в городе(Токио, Киото)? Как-то боязно всё менять сразу в аэропорту.

Есть.

И не надо менять в аэропорту все, в городе курс лучше.

В аэропорту курс может быть выгоднее. Сравните. Ну и названия обменников тоже есть. World currency shop ещё например.

Не бойтесь, в аэропорту лучший курс. В некоторых городах обменники работают с 9 до 5, ни минутой позже) во всех абсолютно достопримечательностях - только кэш, т. к. не платят налоги почти все автоматы пополнения проездных тоже только кэш принимают.