В литовских банковских приложениях формируется ли чек с отметкой о проведении платежа при оплате/переводе средств? Есть вообще такое? Нужно оплатить консульский взнос и предоставить квитанцию. Не скриншот же экрана им распечатывать?.

Обычно скриншот нельзя сделать в приложении) можно через интернет банк в sąskaitos išrašas выбрать нужный вам перевод и сделать pdf файл. Если в самом приложении, то например, в seb, информация о переводе отправляется текстом, что не очень удобно, возможно, в других банках по другому.

Да, в онлайн банке можно сделать выписку конкретной банковской операции.