Могу ли я пересечь границу с Эстонией из РФ, если я еду в Финляндию с ВНЖ Финляндии, но оно первое и въезд тоже первый?

Да, можете, но без задержек и сразу после пересечения нужно ехать в Финляндию. Вам нужно иметь доказательство, что вы едете сразу туда (билеты на самолёт/паром), тогда пропустят спокойно.