Поделитесь опытом, если кто-то оплачивал краткосрочное обучение в Японии из России без иностранных карт. Через какой банк делали? Походом в банк или как-то через приложение можно? Не возникло трудностей при переводе?

Делают банковским переводом. Если есть счёт в этом банке, то можно делать самому через личный кабинет. Комиссия 5 000 йен (была в апреле), все расходы включены. Обратите внимание, валютный контроль строго требует подтверждающие документы - счёт, договор на обучение и т. д., иначе перевод не одобрят. В отделении в Москве берут деньги только наличкой. Счёт можно завести удаленно, карточки они доставляют курьером в другие города, но не во все. Насколько я знаю, еще переводы в йенах делают ББР банк, АТБ и Газпромбанк (но там конская комиссия)