Подскажите, если мы летим в Пхукет транзитом через Дубай ( там будем сутки) нам чемоданы выдадут или отправят их сразу в Пхукет?

Если единый билет одной авиакомпании, то скорее всего багаж не получать в Дубай, на стойке поймёте сразу.

Если билет единый и одной авиакомпаний, то сдать багаж можно сразу до конечного пункта. Если разные авиакомпании - то придётся получать и снова сдавать.