Если друг прилетит из Турции на северную часть Кипра и улетит обратно тоже с северной части без паспорта ЕС, какие последствия?

Возможен бан на ЕС лет на 5. И вообще, это незаконно.

В будущем могут быть проблемы – с получением визы на Кипр - есть кейсы – с получением/продлением ВНЖ Кипра - есть кейсы – с получением ПМЖ Кипра - есть кейсы – с получением гражданства Кипра - есть кейсы А может повезет и ничего этого не случится, но запись в базе останется - это 100%.