Есть ли принципиальная разница если подать заявку на WP до подачи на PR в канаде? или с начала на PR а потом на WP? Судя по информации на официальном сайте, там получается 2 разных подачи. Спасибо.

Вы не написали детали программы, по которой подаетесь, где вы находитесь (в Канаде или за пределами Канады) и какие у вас цели/текущая ситуация (то есть с какой точки зрения оценивать "принципиальность" разницы). Вообще обычно это несвязанные процессы, но они требуют разных документов. Поэтому обычно просто нужно делать с максимально быстро и то, и другое, сфокусировавшись на том, что вам тактически важнее и снижает риски в вашей ситуации. .