Подскажите, имеет смысл искать дом виллу на краткосрок вне агрегаторов на Пхукете? Дешевле приехать выбрать?

Можно и так: снять жилье ненадолго, например, на несколько дней, по прилёту взять байк и объезжать район. Но это если вы приезжаете хотя бы на месяц. Иначе все время уйдет на поиски.