Репатриируюсь в Латвию. Восстанавливаю документы бабушки, в которых в СОР написано одно место рождения, а в СОБ другое (

А населённые пункты в Латвии?

Сложно ответить, видимо единственный верный ответ это проверить подав туда документы. Судя по опыту людей тут, в большинстве своём, даже если вы это спросите перед подачей в обычном электронном письме в PLMP, ответ будет похож на: подавайте документы, разберёмся на месте.