Подскажите пожалуйста, я зарегистрировался как ИП в Грузии, в налоговой пометил себя как неактивный, если я получу оплату от фриланс-платформы, а потом активирую аккаунт это нарушение?

Да, в неактивном статусе Вы не имеете право всети деятельность. Сначала нужно его активировать. И, если не подали заявлление на Малый статус, а работать планируете по нему, то подать, и действовать он начнет со следующего месяца после присвоения, это нужно тоже учесть.