Как аннулируется РВП? Если руководитель снял трудовой договор с сайта «Инбек» РВП аннулируется автоматически?

Технически не аннулируется, пограничники видят его как действующее. А вот при обращении в миграционную вам скажут, что у вас только 15 дней с момента увольнения на оформление нового РВП или выезд из страны. Далее ваше РВП недействительно по закону.