Слышала, что вроде с греческим Шенгеном можно прилететь в Таллин и оттуда в Питер сразу. Но немного страшно, могут ли отказать в посадке на самолет?

Вопрос откуда прилететь?)) Изнутри шенгена можно. Из турции нет.

Последнее время никто не пишет о сложностях такого рода. Нормально проедете.

Нет, посадят без проблем.

Внутри шенгена перелёт без проблем. Но как пример, в Грузии (не шенген) моего супруга проверили перед вылетом в Ригу, ждали подтверждения с границы по свидетельству о браке, как получили его - сели в самолёт.