Из Нариты как до Токио удобно доехать? Есть поезд за 5000, есть ещё варианты? Автобусы норм удобные или лучше на поезде.

На метро за 1000 можно доехать.

Надо понимать где у вас отель. Я предпочитаю автобусы. 1300 йен до Tokyo station. Может быть вам метро лучше подойдёт. Гугл хорошо маршруты строит. На сайте Нариты тоже можно посмотреть варианты с расписанием.

Мы ездили на лимузин автобусе.

5000 это в обе стороны нарита экспресс, с учётом этого неплохой вариант. Скайлайнер быстрее и симпатичнее, 2500 примерно в одну сторону, но только до Уэно. Поезд линии кейсей (простой, не скайлайнер) немного больше 1000 йен, смотря куда в Токио надо, могут быть пересадки. Именно один из поездов кейсей заходит в токийское метро. Либо простой поезд Jr, цена чуть выше, автобусы примерно в том же диапазоне. Смотрите, куда вам с Токио надо. Если на синдзюку, то наверное нарита экспресс будет удобнее.