Подскажите пожалуйста, плохо ли будет если я буду снимать наличные со своей карты для ИП? Может ли это являться причиной для блокировки, например?

Снимайте, это не является чем-то патологическим и странным. А что на данный момент вообще является подозрительным для банков, в частности, для БоГ (кроме гражданства РФ и РБ, например) понять трудно.

Я бы еще добавил, что безналичным переводам надо дать "отлежаться". 2 недели, а еще лучше месяц.