Правильно ли я понимаю, что при регистрации в TBC они привязали мой ИНН ко мне в целом? На оба счёта? А уже какого конкретно счёта IBAN указывать в налоговой анкете, чтобы он считался отчётным по зачислениям ИП, решаю я?

Да, но это не для налоговой анкеты, Вы просто разделите для себя счета, один - для работы, второй - для личных нужд. Привязка в ЛК нужна только для оплаты налогов, если не являетесь плательщиком НДС, можно не привязывать. И привяжется только счёт, основная валюта которого - лари.