Можно ли сейчас пересекать границу на автомобиле с российскими номерами гражданину Латвии (из России в Латвию)?

Все зависит не от гражданства, а от номеров. Если номера российские, то нет.

Нет. в правилах найдете гражданам любых государств, на машине с рос номерами. уле по русски точно найдете эту инфо.