Может быть у кого-то есть опыт декларации места жительства в Вильнюсе в сянюнии: можно ли придти одному, без владельца, имея на руках договор аренды?

Можно. Важно, чтобы в договоре было написано, что арендодатель разрешает задекларировать место жительства. И у Вас на руках внж должно быть. Хотя были сообщения, что в договоре этого не было прописано и декларировали без хозяина .