Подскажите пожалуйста можно ли в Дубае оплачивать в магазинах по qr-коду с помощью qiwi карты?!

Нет.

А как вы себе представляете присутствие российских терминалов оплаты в эмиратовских юрлицах? Это должен быть как минимум договор между магазином (юрлицо в ОАЭ) и каким-то банком в РФ, который будет предоставлять эквайринг. Далее встанет проблема перегона денег из России в ОАЭ. Плюс вопрос налогообложения этих сумм. Плюс постоянные колебания курса. Говорят, какая-то кофейня есть в Марина Молл с российским терминалом, но это скорее экзотика, чем обычная практика.