Подскажите, пожалуйста, каким из 3-х способов лучше оплатить налог ИП с TBC, чтобы потом не разыскивать платеж?

Если к счету привязан ID и основная валюта - лари, то можно привязать его в ЛК налоговой и оплачивать с него. Либо с карты напрямую через личный кабинет.