Подскажите пожалуйста, если я отработал 6 месяцев в 2022 году на острове на кипрского работодателя и заработал 48к, то имею ли я право на 50% налоговую скидку по итогам 2022 года?

Имеете, если контракт гарантировал облагаемый социалкой доход 55000+ за календарный год. Неважно сколько фактически работали, хоть один день 31 декабря. Правда, судя по вопросу, бухгалтерия вам вычет не считала, так что возврат через декларацию - то есть деньги вы года через 4-5 получите.