Подскажите пожалуйста могут ли возникнуть проблемы в аэропорту если вылетаешь в Молдову с России с молдавским загранпаспортом имея гражданство РФ?

Могут и будут, гражданин РФ обязан выезжать по паспорту Рф. Если нет заграна, можно выехать по внутреннему РФ в Армению.

Жена выехала из РФ через Ереван по росс. внутр. паспорту, а дальше в Молдову по молдавскому заграну, а потом пыталась заехать обратно (через Латвию), где выяснилось, что она еще и гражданка России. Пропустили, но сказали, что для поездок за границу она должна сделать российский загран и в следущий раз будет штраф.