У сына в осведчени и в справках, которые выдает школа фамилия и имя прописаны на чешском, то есть как перевел судебный переводчик.

Обычно же переводчик делает приписку, если чешское написание отличается от того, что в паспорте. Мол фамилия/имя в паспорте такая-то.

Нужно поменять, как в паспорте, при поступлении в вуз или переводе в другие школы, могут возникнуть вопросы. Меня об этом предупредили в школе, хотя речь шла о написании одной л или лл в имени ребенка.