Если я в Литве с Израильским паспортом, а мне надо в Москву, то получается нужно купить билет Калининград-Москва, а на поезд можно сесть в Кяне?

Да есть и рф, и израиль паспорта, спасибо.

Москва- Калининград покупается на заграничный паспорт РФ И отдельно дают транзитную визу Делается сутки после покупки билета Всё уточняйте в кассах ржд.