Если в старом контракте я фигурировал как Консультант, хотя смысл моей работы попадает под перечень малого бизнеса ( разработка в ит)

Нет, не попадете автоматически, просто нужно будет при проверке доказывать, что Вы не оказываете услуги консалтинга, а это бывает сделать непросто. И, если доказать не удастся, тогда может быть возбуждено дело и камеральная проверка, а дальше уже расследование. Решение выносится судом. Но, чтобы избежать таких проблем, в контракте нужно все прописывать максимально однозначно.