Подскажите, пожалуйста, что делать, если заказчик из Чехии хочет оплатить договор наличкой, сам приедет сюда в Грузию.

Оплаты наличкой ИП принимает через кассовый аппарат. И, если это услуги иностранному заказчику, оказываемые электронным способом, то при оплате их налом в Грузии они попадут под НДС при превышении 100 к лари/12 мес, так как уже будут оказаны не дистанционно и местом из оказания для целей НДС тогда уже будет Грузия. При оплате с иностранного счета Заказчика они освобождаются от НДС.