Подскажите, С жд билетом Калининград-Смоленск и оформленным упд-жд хочу сойти в Минске. Понимаю, что сделать это реально, но сталкивался ли кто-то с последствиями?!

Какие последствия? Поезд останавливается в Минске, на территории Союзного государства) Правда ночью уже. Раньше проводницы ворчали, но сейчас даже в Литве, где обозначена техническая остановка, по нужным документам вылезают и садятся) УПД-ЖД Вы честно используете, проехав транзитом Литву) Претензий от Литвы к Вам не будет)