Буду ехать из Стамбула в Белград на поезде хочу отметить что есть мульти шенгенская виза на пол года до 01.02.2024 нужна ли мне транзитная виза в Болгарию ?

Не нужна, шенгена достаточно.

В Болгарию можно въезжать по шенгенской визе. Уверены что поезд такой есть?

Главное чтобы она была отъезжена в ту страну, что ее выдала, иначе болгары не пустят, если это не их виза.