У кого есть опыт репатриации в Израиль, подскажите, пожалуйста: если не писать Отказ от Отказа

Не имеет значения, можете выезжать. Но я не вижу смысла НЕ подавать отказ, если вы не планируете переходить в статус ПМЖ.

Нет не нужно , можете даже через три месяца в консульстве получить ТМ но он будет не биометрическим.