Подскажите пожалуйста кто-нибудь знает, можно въехать из России в Эстонию по израильскому паспорту, при наличии российского гражданства?)

Можно 90 дней в полугодии, как весь Шенген. Но будет готовы, что вам надо представить план поездки, где будете ночевать, когда выйдет, и вообще зачем едете.