Кто-нибудь может подсказать если в загранпаспорте поставить штамп о прописке в Армении, такой загранпаспорт будет действительным?

Да, будет. У меня стоит такой штамп, без проблем пересекала границу.

Да, паспорт будет действителен, не переживайте, у меня даже штамп с Мачу-Пикчу стоял, никому дела не было до этого штампа. И армянская прописка сейчас стоит, съездил с ней уже несколько раз за границу.