Работаю на двух работах. На одной официально, на другой по ГПХ. В DS-160 указывать обе работы или только ту на которой официально?

Можно и обе. У вас же есть движение средств зп по счетам? Можете их с собой взять. У них же нет понятия трудовая книжка))) А доход в месяц получается плюсуете вместе.

Укажите где больше работаете или что престижная работа. При желание они могут позвонить и спросить что вы работаете там или нет .