У кого есть опыт легализации в Аргентине, скажите, апостиль нужно ставить непосредственно на свидетельство о рождении или на нотариально заверенную копию тоже прокатит?

Лучше на оригинал. А тем временем заказать на родине дубликат на всякий случай.

Так апостиль с обратной стороны свидетельства ставят, если оно относительно новое, бумажкой. Какие могут быть проблемы?