Подскажите пожалуйста, может, рейсы Москва - Литва через Латвию и не через Бурачки?

В Вильнюс все автобусы с пересадками. Зависит от перевозчика, если Ecolines, то через ад Бурачки. Если через Минск, то нет. Вам вообще зачем с автобусом заморачиваться?. Езжайте в Минск поездом, а оттуда в Литву.

Может быть, вам подойдет: на самолёте долететь до Калининграда, и через два-четыре часа вы в Литве.:) -- тут что вам ближе, Панемуне или Кибартай.