Если у меня ип в рф , но доход от фриланса за пределами Португалии из списка стран , то налог я плачу только в России ?

Платите налоги с мирового дохода там, где являетесь налоговым резидентом.

Зависит от того, чем именно занимаетесь, а также от того, что является непосредственным местом работы. Если у вас в РФ есть официальный представитель, место ведения деятельности (у ИП - это адрес по прописке), и вы выезжаете за пределы Португалии, чтобы на месте там уже вести свои дела, то это все будет основанием доказательства, что фактическим местом получения дохода является РФ. Далее, по месту получения дохода доход и облагается - то есть в РФ. Далее, открываем соглашение об избежании двойного налогообложения. Статья 14, пункт 1. Изучайте документы сами (первоисточники) и ищите профессионалов, которые дадут вам ответы на сложные вопросы. Ищите профи по международному налогообложению. Лучше - британцев или американцев. Добрый совет. Иные редко дают по сложным вопросам взвешенный ответ.