Подскажите пожалуйста, если я сначала лечу в Шанхай на несколько дней, а затем в другой город учиться на постоянку, что в этом случае будет городом приостановки при заполнении анкеты на визу в Китай?

Пункт с прилет/вылет? Если да, то первым городом вы указываете город, в который прилетаете изначально (то есть Шанхай), вторым - а котором остаетесь. Нам, по крайней мере, преподаватели сказали делать так.