Все привет, подскажите пожалуйста пропускают ли через границу Эстонии с двойным гражданством (немецким) без визы?

Двойное гражданство у гр. РФ может быть только с Таджикистаном.

У вас должно быть 2 паспорта))) Вы, как гражданин ЕС, можете въехать на территорию сообщества.

Да. В Россию вы въезжаете по российскому заграну, в ЕС - по европейскому паспорту (паспорт обязателен для границы, карточка не подходит).