Где лучше брать билет на самолёт на официальном сайте или у агрегатора?

Не принципиально, где дешевле, там и берите.

Если есть возможность то берите у авиакомпании, мы взяли через агрегатор и один из перелётов компания тупов отменила, при обращении к ним было сказано что если бы брали у нас - мы бы без проблем поменяли вам рейсы, а так обращайтесь туда где брали, сейчас пробуем через них поменять.