Подскажите по вопросу нахождения на территории Европы в следующем случае: я получаю визу D3 Португалии, мне назначают дату обмена визы на ВНЖ 1)

забирают ли паспорт на время одобрения визы? 2) забирают ли паспорт на время обмена визы на ВНЖ? как понимаю обе процедуры занимают пару месяцев 3) если я жду обмен визы на ВНЖ, то могу находиться на территории Португалии дольше 90 дней. При этом могу ли я выезжать, если паспорт на руках? или после 90 дней никуда нельзя? мне сказали, что как основание въезда можно использовать трудовой договор. так ли это? был ли у кого-то такой опыт? заранее большое спасибо!