Скажите, онлайн возможно какие-либо транспортные карты приобрести? Или только вживую всё, когда уже там, в Японии буду?

Для путешествий jr pass. Покупается он не в Японии на определений срок. Стоит дорого и становится выгодным если много ездить. Можно попытаться оформить цифровую pasmo или suica с телефона. Для этого надо сменить регион в телефоне на японский. У меня не получилось ее пополнить, но у кого то получалось.

Посмотрите разные jr пассы, их можно купить онлайн и в аэропорту в автомате распечатать. Например по jr wide Tokyo pass можно много всего объездить вокруг Токио, в том числе из аэропорта доехать.