Я правильно понимаю, что: 1. Налоги оплачивать лучше со счёта ИП? 2. Если у меня ИП на УСН или ИТ-сертификат, то я спокойно могу пополнять счёт ИП со счёта ФЛ в том же банке, не опасаясь вопросов от налоговой?

Насколько я понимаю, например в инеко оплатить налоги возможно только со счёта ИП. иначе можно оплатить только через кассу банка. так как там указывается tax id, а при оплате со счёта физлица для него нет поля.

1. Да, но можно и со счета ФЛ. 2. Да и с обычным режимом тоже.