Подскажите, пожалуйста, обязательно ли чтобы в референс письме с работы работодатель указывал время в декретном отпуске?

Если нет возможности, то не обязательно. В профиле указывайте реальное время работы - без декрета и без отпуска по уходу за ребенком, к референсу приложите LoE с объяснением, что в такой-то период времени вы не работали, поэтому в ворк хистори его не указали, но работодатель это время указал, т. к. по закону вы "числились" на работе.