Летим с домашним питомцем из Еревана в Стамбул, меняем аэропорт и дальше летим в Манилу авиакомпанией Pegasus, подскажите, в каком момент нужно дать питомцу таблетку от глистов?

И не найдете, потому что это устанавливает страна въезда, а не авиакомпания. как правило, за 24-120 часов до выезда обрабатывать. если Филиппины не требуют обработку, то она и не нужна.