При аренде квартиры собственник сообщил, что он имеет право сдавать только зарегистрировав в квартире нас с супругой. И потребовал основания для пребывания))это я что-то не так понял или собственник?

Собственник имеет право вам сдавать, заключив договор с вами и зарегистрировав его вместе с вами в РСЦ. И далее, регистрация (вместе с основанием и договором на руках) это уже ваша забота и ответственность. Я так вижу)) Может у него такая прихоть и он хочет вас проконтролировать, не знаю)) Удачи вам))