Подскажите, пожалуйста, как лучше долететь из Москвы в Ларнаку, чтобы пересадка была небольшая.

В Ларнаку летит почти всё. Лучше всего Эмиратами. Летают идеально.

С небольшой пересадкой если только одна авиакомпания на оба сегмента и единый билет. Купленный не через посредников. Иначе есть риск опоздать на следующий рейс.