Я гражданин РФ, планирую ехать в Кишинёв, в израильский центр, для получение визы на репатриацию в я Израиль. Как сделать официальное приглашение, через МВД, что бы снять риск того, что не пустят?

Попросите от центра приглашение на прием. В произвольной форме с печатью. С такой должны пустить Вопрос только в том что в рф есть посольство Израиля, и есть доля вероятности что спросят на границе почему не обратились в посольство? Официальных приглашений для рф нет, и не будет, хоть кем подписанных.